世界各地通常使用生化檢測方法進(jìn)行新生兒篩查 (NBS)。基因測序的最新進(jìn)展可能會改變新生兒篩查的游戲規(guī)則，能夠快速評估各種單基因疾病。然而，基因測序作為 NBS 替代方法的有效性此前尚未被研究過。
為了評估將基因組測序作為一級新生兒篩查測試的結(jié)果，國家統(tǒng)計(jì)局八個(gè)中心和華大基因組最近進(jìn)行的一項(xiàng)研究發(fā)表在《JAMA Network Open》上。
這項(xiàng)開創(chuàng)性研究將基因組測序納入 NBS，作為大規(guī)模人口規(guī)模的同步一級篩查策略，這些結(jié)果表明，大約每 500 名新生兒中就有一個(gè)受益于將基因組測序作為一級篩查的整合測試。
方法和結(jié)果：
研究人員旨在評估基因測序方法檢測新生兒單基因疾病的能力。這項(xiàng)前瞻性隊(duì)列研究納入了2021年2月21日至12月31日期間從中國八個(gè)新生兒篩查中心招募的29,601名新生兒。對結(jié)果呈陽性的新生兒在2022年7月5日之前進(jìn)行了隨訪。
該篩選包括針對 128 種情況的生化篩選測試和靶向基因組測序測試。生化和基因組測試均可檢測出其中 43 種病癥，而其他 85 種病癥僅通過基因組進(jìn)行篩選。
主要發(fā)現(xiàn)包括：
1. 通過基因測序，813 名嬰兒篩查呈陽性(2.7%;95% CI，2.6%-2.9%)，其中 402 名嬰兒得到診斷，陽性預(yù)測值為 50.4%(95% CI，50.0%) -53.9%)。
2. 基因組測序確定了 59 名未通過生化檢測檢測到的患者，其中包括 20 名患有生化和基因篩查疾病的患者和 39 名僅患有基因篩查疾病的患者，這相當(dāng)于每 500 名新生兒中就有 1 名(95% CI，1/ 385-1/625)。
3. 共有445名新生兒經(jīng)NBS遺傳和生化篩查確診為13種疾病，其中包括G6PD缺乏癥(328名新生兒)、先天性甲狀腺功能減退癥和單純性HTT(94名新生兒)以及氨基酸、有機(jī)酸或脂肪酸氧化疾病(23 名新生兒)。雖然其中 82 名患者未通過基因 NBS 檢測到(并通過生化 NBS 檢測到)，但值得注意的是，其中 20 名患者通過基因 NBS 檢測到(而未通過生化 NBS 檢測到)。
4. 共鑒定出 328 名 G6PD 缺乏癥患者(282 名男性和 46 名女性)。全部經(jīng)基因NBS檢出，但10例男性患者生化NBS未檢出;相反，它們在驗(yàn)證性測試中得到了證實(shí)。總體而言，熒光測定的敏感性為 96.95%(95% CI，94.48%-98.33%)，特異性為 99.71%(95% CI，99.64%-99.77%)，而遺傳 NBS 的敏感性為 100%( G6PD 缺乏癥的特異性為 95% CI，98.84%-100%)，特異性為 98.61%(95% CI，98.46%-98.75%)。
利用 NBS 的基因測序
本研究將遺傳 NBS 的結(jié)果呈現(xiàn)為臨床環(huán)境中的一級篩查測試，這對于臨床醫(yī)生、遺傳學(xué)家和家庭提供更好的醫(yī)療保健和咨詢非常重要。
例如，將遺傳與生化 NBS 相結(jié)合的一個(gè)好處是減少誤報(bào)的數(shù)量。本研究的數(shù)據(jù)表明，除了女性新生兒中 G6PD 的熒光檢測外，遺傳 NBS 的陽性預(yù)測值 (PPV) 顯著高于生化 NBS。氨基酸、有機(jī)酸和脂肪酸氧化障礙的差異非常明顯(遺傳 NBS 為 70.83%，串聯(lián)質(zhì)譜為 5.29%;P < .001)，這與之前的研究一致。減少誤報(bào)數(shù)量反過來會減輕父母的壓力和焦慮，并減少隨訪次數(shù)。
研究小組承認(rèn)，需要進(jìn)一步的研究和合作來在全球人群和醫(yī)療保健系統(tǒng)中驗(yàn)證這些發(fā)現(xiàn)，這將導(dǎo)致新生兒篩查方案的細(xì)化和優(yōu)化。
該項(xiàng)目遵循生物和醫(yī)學(xué)研究相關(guān)規(guī)定，并已獲得八家新生兒篩查中心和華大基因倫理委員會的批準(zhǔn)。
